Statistics 565

Methods in Biostatistics

 

Lecture Notes: (pdf files with 4 slides per page)

    1. Introduction  (updated 8/23/05)
    2. Observational Studies (updated 8/31/05)
    3.
Randomized Clinical Trials  (updated 9/05/05)
    4.  Models for time to event analysis  (updated 9/09/05)
    5.
 Nonparametric estimation  (updated 9/25/05)
    6.
 Proportional hazards models  (updated 10/06/05 )
    7.  Power and Diagnostics     (updated 10/15/05 )
    8.  Longitudinal Studies (Part I)    (updated 11/07/05 ) 
    9.  Longitudinal Studies (Part II)    (updated 11/15/05 )
  10.  Longitudinal Studies (Part III)    (updated 11/29/05 )
  11.  Nonlinear Mixed Models    (updated 12/05/05 )

Computer Code and Data Files
Used in the Lecture Notes (text files):

                                                                                                   
                 SAS                  DATA                    R                 

     1.     mcnemar.sas           midiab.matched.txt           midiab.matched.R    
     2.                                                                              margodds.R          
     3.
      benignbreast.sas           bbdm13.dat     
     4.
                                           bbreast.txt                 benignbreast.R   
     5.
      lead.sas                                                                 lead.R     

     6.      randombin.sas                                                 randombin.R    
     7.
      randomblock.sas                                             randomblock.R     
     8.
     weibull1.sas              bcancer1.dat                   weibull1.R                  
     9.
     weibull2.sas              bcancer2.dat                   weibull2.R 
   
10.
     vakm.sas                           va.dat                     vakm.R 
   11.
     smooth macro                    va.dat                     vakm.smooth.R 
   12.
     LINRANK macro          (Weighted linear rank tests)
   13.
     RAND_GEN macro 
   14.
     PERM_GEN macro        (Generate all possible random assignments)
 
 15.      TEST macro                  (Compute p-values for randomization distributions)
   
16.
     SURVPOW macro           (Compute power)
    17.
     va.perm.sas 
   18.
     spower.sas    
    19.       vacoxph.sas                    va.dat                         vacoxph.R 
   20.
      vacoxph2.sas                  va.dat                   (Model Selection) 
 
 21.
      vacoxph3.sas                  va.dat                          vacoxph3.R
   22.
      phpow.macro.sas      (marco for computing power or sampes sizes)
   23.       vacoxph.diag.sas             va.dat                         vacoxph.diag.R 
   24.
      schoen.macro.sas      (marco for computing Schoenfeld residuals)
   25.       daspline.macro.sas      (marco for fitting splines )
   26.       phlev.macro.sas      

   27.       rats.sas                          rats.dat                           rats.R  
   28.
      milkprotein.sas             dhlx.example1_4.data    milkprotein.R  
   
29.
      pigment.sas                  pigment.dat                      
   30.
      milkprotein3.sas            dhlx.example1_4.dat     
   31.
      dhlz.example8_1.sas      dhlx.example8_1.dat     
   32.
      nestgee.sas                            
   33.
      seizures.sas                    seizures.dat        
   34.
      seizglmm.sas                  seizures.dat      
   35.
      nestglmm.sas                    
   36.
      glmm800.sas